MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 41104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015562	TCA	2	6	205401	205406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910090
4502	NC_015562	TTTC	2	8	205412	205419	0 %	75 %	0 %	25 %	333910090
4503	NC_015562	A	6	6	205437	205442	100 %	0 %	0 %	0 %	333910090
4504	NC_015562	ATC	2	6	205475	205480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910090
4505	NC_015562	CTTC	2	8	205500	205507	0 %	50 %	0 %	50 %	333910090
4506	NC_015562	AAAC	2	8	205538	205545	75 %	0 %	0 %	25 %	333910090
4507	NC_015562	A	6	6	205561	205566	100 %	0 %	0 %	0 %	333910090
4508	NC_015562	GTT	2	6	205579	205584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910090
4509	NC_015562	TAA	2	6	205622	205627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910090
4510	NC_015562	ACA	2	6	205647	205652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910090
4511	NC_015562	T	6	6	205691	205696	0 %	100 %	0 %	0 %	333910090
4512	NC_015562	TAA	2	6	205715	205720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910090
4513	NC_015562	ATT	2	6	205724	205729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910090
4514	NC_015562	CAT	2	6	205744	205749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910090
4515	NC_015562	TCT	2	6	205753	205758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910090
4516	NC_015562	CAAA	2	8	205864	205871	75 %	0 %	0 %	25 %	333910090
4517	NC_015562	T	6	6	205878	205883	0 %	100 %	0 %	0 %	333910090
4518	NC_015562	GTA	2	6	205884	205889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910090
4519	NC_015562	TCT	2	6	205977	205982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910090
4520	NC_015562	GTT	2	6	206001	206006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910090
4521	NC_015562	AAAT	2	8	206034	206041	75 %	25 %	0 %	0 %	333910090
4522	NC_015562	TC	3	6	206083	206088	0 %	50 %	0 %	50 %	333910090
4523	NC_015562	A	6	6	206099	206104	100 %	0 %	0 %	0 %	333910090
4524	NC_015562	TTA	2	6	206795	206800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910091
4525	NC_015562	GGGA	2	8	206811	206818	25 %	0 %	75 %	0 %	333910091
4526	NC_015562	AG	3	6	206868	206873	50 %	0 %	50 %	0 %	333910091
4527	NC_015562	AAAGA	2	10	206911	206920	80 %	0 %	20 %	0 %	333910091
4528	NC_015562	TAA	2	6	206936	206941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910091
4529	NC_015562	TGG	3	9	206949	206957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910091
4530	NC_015562	A	6	6	206979	206984	100 %	0 %	0 %	0 %	333910091
4531	NC_015562	GAG	2	6	207048	207053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910091
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4533	NC_015562	CTG	2	6	207098	207103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910091
4534	NC_015562	CTTC	2	8	207119	207126	0 %	50 %	0 %	50 %	333910091
4535	NC_015562	AAG	2	6	207136	207141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910091
4536	NC_015562	TGT	2	6	207201	207206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910091
4537	NC_015562	TTG	2	6	207218	207223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910091
4538	NC_015562	GAT	3	9	207229	207237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910091
4539	NC_015562	TGG	2	6	207429	207434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910091
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4541	NC_015562	AT	3	6	207509	207514	50 %	50 %	0 %	0 %	333910091
4542	NC_015562	TCA	2	6	207548	207553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910091
4543	NC_015562	TTATT	2	10	207593	207602	20 %	80 %	0 %	0 %	333910092
4544	NC_015562	GATT	2	8	207648	207655	25 %	50 %	25 %	0 %	333910092
4545	NC_015562	ACA	2	6	207661	207666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910092
4546	NC_015562	AGA	2	6	207675	207680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910092
4547	NC_015562	ACA	2	6	207688	207693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910092
4548	NC_015562	ATC	2	6	207694	207699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910092
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4550	NC_015562	GAG	2	6	207739	207744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910092
4551	NC_015562	TGTGT	2	10	207786	207795	0 %	60 %	40 %	0 %	333910092
4552	NC_015562	CAA	2	6	207920	207925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910092
4553	NC_015562	CAA	2	6	207932	207937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910092
4554	NC_015562	GAC	2	6	207973	207978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910092
4555	NC_015562	GAAG	2	8	208011	208018	50 %	0 %	50 %	0 %	333910092
4556	NC_015562	CAA	2	6	208049	208054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910092
4557	NC_015562	AGA	2	6	208096	208101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910092
4558	NC_015562	AGG	2	6	208107	208112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910092
4559	NC_015562	TCA	2	6	208124	208129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910092
4560	NC_015562	GAG	2	6	208159	208164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910092
4561	NC_015562	A	6	6	208167	208172	100 %	0 %	0 %	0 %	333910092
4562	NC_015562	CTG	2	6	208178	208183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910092
4563	NC_015562	GAC	2	6	208219	208224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910092
4564	NC_015562	AATT	2	8	208232	208239	50 %	50 %	0 %	0 %	333910092
4565	NC_015562	TTG	2	6	208315	208320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910092
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4572	NC_015562	AAAAG	2	10	208473	208482	80 %	0 %	20 %	0 %	333910092
4573	NC_015562	AT	3	6	208518	208523	50 %	50 %	0 %	0 %	333910092
4574	NC_015562	AG	3	6	208785	208790	50 %	0 %	50 %	0 %	333910093
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4579	NC_015562	GAA	3	9	208950	208958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910093
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4582	NC_015562	A	6	6	209010	209015	100 %	0 %	0 %	0 %	333910093
4583	NC_015562	AAAATT	2	12	209027	209038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910093
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4588	NC_015562	GCA	2	6	209167	209172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910094
4589	NC_015562	AGTT	2	8	209177	209184	25 %	50 %	25 %	0 %	333910094
4590	NC_015562	TA	4	8	209207	209214	50 %	50 %	0 %	0 %	333910094
4591	NC_015562	A	6	6	209214	209219	100 %	0 %	0 %	0 %	333910094
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4595	NC_015562	ATA	2	6	209498	209503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910094
4596	NC_015562	AATA	2	8	209507	209514	75 %	25 %	0 %	0 %	333910094
4597	NC_015562	CTT	2	6	209605	209610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910095
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4599	NC_015562	GTT	2	6	209652	209657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910095
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4602	NC_015562	TTG	2	6	209752	209757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910095
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4604	NC_015562	AAC	2	6	209921	209926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910095
4605	NC_015562	TA	3	6	209975	209980	50 %	50 %	0 %	0 %	333910095
4606	NC_015562	ATC	2	6	209999	210004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910095
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4608	NC_015562	AAC	2	6	210039	210044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910095
4609	NC_015562	CTT	2	6	210094	210099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910095
4610	NC_015562	T	6	6	210107	210112	0 %	100 %	0 %	0 %	333910095
4611	NC_015562	TC	3	6	210149	210154	0 %	50 %	0 %	50 %	333910095
4612	NC_015562	TTA	2	6	210169	210174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910095
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4614	NC_015562	TGT	2	6	210185	210190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910095
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4621	NC_015562	T	6	6	210445	210450	0 %	100 %	0 %	0 %	333910095
4622	NC_015562	CTT	2	6	210535	210540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910095
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4999	NC_015562	TGA	4	12	225946	225957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910109
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